Tujuan dari sunat adalah menjaga kebersihan dan mencegah infeksi pada area penis. Bagian dalam prepusium lembab dan hangat, sehingga jika tidak dibersihkan dengan baik, dapat mendukung pertumbuhan bakteri penyebab infeksi.
Selain itu, sunat juga dapat membantu mencegah penularan penyakit menular seksual, seperti HIV, pada pria yang tidak disunat.
Karena sel-sel di kulit bagian dalam prepusium dan preputium terpapar langsung selama hubungan seksual, dan lokasi sel target HIV berada di sana, sunat dapat mengurangi risiko infeksi.
Sebaliknya, pada pria yang telah disunat, jaringan tebal keratin menutupi batang penis, memberikan perlindungan dari infeksi.